Najlepszy sposób na obsługę dużego (UUID) jako klucza podstawowego tabeli MySQL

W większości przypadków najlepiej przechowywać UUID/GUID jako BINARY(16) . Zobacz te powiązane pytania dotyczące StackOverflow:

• Wydajność UUID w MySQL
• Jak przechowywać UUID jako numer

Konwersję można (i prawdopodobnie należy) wykonać w MySQL zamiast w PHP, więc to, czy używasz 32-bitowego klienta PHP, czy 64-bitowego, nie ma większego znaczenia (kalambur przeznaczony :P)