po prostu użyj INSERT...ON DUPLICATE KEY UPDATE
INSERT INTO reports_adv (day, uid, siteid, cid, visits)
VALUES ('$day', '$uid', '$sid', '$cid', 1)
ON DUPLICATE KEY UPDATE visits=visits+1;
ale przede wszystkim powinieneś zdefiniować UNIQUE
ograniczenie na kolumny.
ALTER TABLE reports_adv ADD CONSTRAINT tb_uq UNIQUE (day, uid, siteid, cid)