Istnieją wersje mysqldb dla Pythona 2.6, po prostu nie są dostępne na oficjalnej stronie. Zajęło mi to trochę czasu (i niestety zgubiłem link), ale możesz przeszukać google i znaleźć ludzi, którzy skompilowali i wydali 2.6 wersje mysqldb dla Windows x64 i x32.
EDYCJA:
http://sourceforge.net/forum/forum.php?thread_id=3108914&forum_id =70460
http://sourceforge.net/forum/forum.php?thread_id=2316047&forum_id =70460
Ten fourm ma link do wersji mysqldb dla Pythona 2.6