Czy istnieje inny sposób zaimplementowania tego programu bez użycia zagnieżdżonej pętli while?

Ponieważ wszystkie dane użyte w INSERT Instrukcja pochodzi z instrukcji 'SELECT', nie ma sensu podejmować dodatkowej podróży w obie strony między aplikacją Java a bazą danych. Wykonywanie wszystkiego za pomocą jednej instrukcji SQL zapewni najlepszą wydajność.

Twoja instrukcja SQL powinna wyglądać tak

INSERT INTO snomedinfo_data (refid,id,effectivetime,active,moduleid,conceptid,languagecode,typeid,term,caseSignificanceid)
SELECT d.refid, d.id, d.effectivetime, d.active, d.moduleid, d.conceptid, d.languagecode, d.typeid, d.term, d.caseSignificanceid
FROM snomed_descriptiondata d
JOIN snomed_conceptdata c ON c.id = d.conceptid AND c.active = 1 AND d.active = 1

Twój kod Java można sprowadzić do tego

try {
    oRoot = Root.createDbConnection(null);
    String sql = "INSERT INTO snomedinfo_data...";
    oPrStmt = oRoot.con.prepareStatement(sql);
    oPrStmt.executeUpdate();
}