Nie stracisz danych. Ten komunikat o błędzie jest specyficzny dla Ciebie, gdy próbujesz zobaczyć zawartość tabeli i wybierasz zbyt wiele wierszy naraz. Liczba kolumn w tabeli pomnożona przez liczbę wyświetlanych wierszy powinna być poniżej wartości ustawionej dla max_input_vars w twoim php.ini. Domyślnie jest to ustawione na 1000.
Podczas pracy z konkretnym kodem nie powinieneś napotkać tego błędu, CHYBA ŻE spróbujesz zrobić to samo — wyświetlić więcej niż 1000 „elementów” z zwróconego zapytania w jednym momencie. Czy naprawdę tego oczekujesz? Jeśli tak, spójrz na strony i użyj LIMIT w zapytaniu SQL.
Same dane są bezpieczne. Jedyną rzeczą, na którą ma to wpływ, jest zdolność PHP do pobierania i wysyłania.