W moim przypadku ten błąd pojawił się konkretnie przy pustym wartości geometrii w kolumnie geometrii innej niż null.
W moim przypadku puste geometrie były uzasadnionymi przypadkami nieznanej geometrii, więc rozwiązałem ten problem, zmieniając kolumnę, aby zezwolić na wartości null, a następnie uruchamiając UPDATE ... SET geom = NULL WHERE IsEmpty(geom);
Po tym mogłem ponownie uruchomić mysqldump i pomyślnie zaimportuj wynikowy sql do oddzielnej bazy danych.
(Szczerze mówiąc, nie jestem pewien, w jaki sposób w ogóle się tam znalazły wartości pustej geometrii - nie znam nawet składni tworzenia pustej wartości geometrii)
