Miałem ten sam problem w systemie Snow Leopard, gniazdo pojawia się z jakiegoś powodu w złym miejscu w systemie OS X.
Aby umieścić gniazdo we właściwej lokalizacji:utwórz nowy plik "my.cnf" w /etc z następującymi liniami:
[mysqld]
socket=/var/mysql/mysql.sock
[client]
socket=/var/mysql/mysql.sock
i zrestartuj mysqld:sudo /usr/local/mysql/bin/mysqld_safe
Zmusi to plik gniazda MySQL do odrodzenia się we właściwej lokalizacji i wszystko powinno działać normalnie. Powodzenia!