Myślę, że już uruchomiłeś migrację o nazwie version_1.001_initial przed zmianą nazwy aplikacji na beta . Wystarczy zaktualizować rekordy bazy danych w tabeli django_migrations i zmień nazwę starych migracji aplikacji na nową, używając tej instrukcji SQL:
UPDATE django_migrations SET app = 'beta' WHERE app = 'version_1';