Wygląda na to, że używasz InnoDB tabel, więc powinieneś również skopiować pliki ib* do folderu danych (ale to nadpisze każdą tabelę InnoDB utworzoną w nowej instalacji).
Alternatywnie (jeszcze lepiej) możesz ustawić parametr 'datadir' w pliku konfiguracyjnym i określić ścieżkę do folderu danych w starej instalacji.
