Nie możesz odfiltrować wierszy za pomocą funkcji LOAD DATA INFILE, więc albo odfiltruj je, wstępnie przetwarzając plik CSV, albo załaduj dane do tymczasowej tabeli i wstaw odpowiednie wiersze do głównej tabeli, na przykład;
CREATE TEMP TABLE import LIKE my_main_table;
LOAD DATA LOCAL INFILE 'myfile.csv' into import;
INSERT INTO my_main_table SELECT * FROM import
WHERE column_x IN(VALID1, VALID2, VALID3)