Navicat może to zrobić za Ciebie. Będzie również synchronizować schemat i/lub dane między dwiema instancjami bazy danych mysql. Używałem go z powodzeniem w przeszłości.
http://www.navicat.com/en/products/navicat_mysql/mysql_overview .html
Tutaj znajduje się zrzut ekranu narzędzia do synchronizacji danych i struktury:
http://www.navicat.com/en/products/navicat_mysql /mysql_detail_mac.html#7