Wygląda na to, że szukasz czegoś takiego:
UPDATE tbl_accounts
SET nation_id =
CASE id_account
WHEN 3 THEN 3331
WHEN 5 THEN 5551
ELSE nation_id
END,
group_id =
CASE id_account
WHEN 3 THEN 3332
WHEN 5 THEN 5552
ELSE group_id
END
Ale robienie oddzielnych aktualizacji jest rozsądnym rozwiązaniem w tej sytuacji. Powyższe zapytanie będzie wymagało sprawdzenia każdego wiersza w tabeli, aby sprawdzić, czy spełnia on warunek. Jeśli masz indeks na id_account (i prawdopodobnie robisz to, co wydaje się być kluczem podstawowym), aktualizacja pojedynczego wiersza będzie bardzo szybka.
UPDATE tbl_accounts SET nation_id = 3331, groupid = 3332 WHERE id_account = 3
UPDATE tbl_accounts SET nation_id = 5551, groupid = 5552 WHERE id_account = 5