Nie sądzę, że hosting Windows pozwala na niestandardowe PHP5.ini :(
Sprawdzam ich stronę pomocy i artykuł, do którego się podałeś, dotyczy serwerów Linux.
Również porównanie planów na tej stronie:http://www.godaddy .com/gdshop/hosting/shared.asp?ci=9009 pokazuje, że Linux dopuszcza niestandardowe PHP5.ini, ale nie Windows
Zastanawiam się, czy próba użycia jednej z nich psuje PHP i sprawia, że funkcja "mysql_connect", której próbujesz użyć, jest niedostępna.