Również sterownik mySQL JDBC był przez długi czas dopracowywany i zawiera kilka poprawek optymalizacyjnych, takich jak buforowanie metadanych. Byłbym zaskoczony, że programiści JDBC pozostawiliby w sterowniku dużo narzutu TCP/IP.
Przejście przez JNI do implementacji opartej na C prawdopodobnie kosztowałoby więcej w przejściu do kodu natywnego, niż można by uzyskać dzięki zmniejszeniu obciążenia TCP/IP.
Jeśli naprawdę chcesz zmniejszyć obciążenie TCP/IP, możesz rozważyć użycie wbudowanej bazy danych, takiej jak sqlite, derby lub hipersoniczna.