Zależy to całkowicie od typu Twojej witryny. Jeśli tworzysz mały projekt za pomocą samego interfejsu internetowego, pozostań przy swoich wywołaniach mysql.
Jeśli tworzysz witrynę, która ma się rozrosnąć i obsługiwać więcej niż jedną usługę, np. aplikacja na Androida/iPhone'a jest już zaplanowana, zbuduj interfejs API i pozwól obu aplikacjom z niego korzystać. Interfejsy API świetnie nadają się do skalowalności i obsługi wielu klientów. dla miejscowego dentysty to po prostu obciążenie.