Zamykam ten problem, udało mi się skompilować źródło ze starszą wersją Visual Studio, VS2013 x64 i CMake 4.3.1 ...
Wygląda na to, że nowe zmiany w Visual Studio 2015 łamią kod źródłowy złącza C. Mam nadzieję, że zespół MySQL naprawi to w przyszłej wersji.