Możesz użyć pymysql. "Celem PyMySQL jest bycie zamiennikiem typu drop-in dla MySQLdb". Sprawdź dokumentację tutaj . Zainstaluj następujące biblioteki
Po zainstalowaniu tych bibliotek wystarczy dodać wiersze w manage.py w swoim projekcie i użyj ustawień bazy danych dla mysql.
Teraz wszystkie pliki, które import MySQLdb zadziała.