Wstawianie danych zakodowanych w formacie json do mysql

Ponieważ masz tablicę tablic, poprawny foreach wyglądałby tak:

$values = array();
foreach ($newelement as $element) {
    $values[] = "('".mysql_real_escape_string($element[0])."','".mysql_real_escape_string($element[1])."')";
}

$db_insert = mysql_query("INSERT INTO fruits (fruit,color) VALUES ".implode(",", $values);