Jest to normalne z powodu niejawnego dołączenia, którego dokonałeś! Dlaczego po prostu nie zażądasz dwóch zapytań, po jednym na tabelę, a następnie scalisz wyniki w jedną tablicę?
public function getcentrelist()
{
$this->load->database();
$query_courses= $this->db->query('SELECT course_name as name from tbl_training_courses');
$query_centers= $this->db->query('SELECT centre_name as name from tbl_traning_centres');
$courses = $query_courses->result();
$centers = $query_centers->result();
return array_merge($courses,$centers);
}
Zwróć uwagę, że zmieniłem nazwy pól nazwa_kursu i nazwa centrum na ujednoliconą nazwę:"nazwa", jest to konieczne, aby mieć spójną połączoną tabelę.