Niestety nie wiem, jak wyłączyć logowanie MySQL dla poszczególnych instrukcji. Z tego powodu dokumentacja MySQL radzi, aby logi były zabezpieczone:
Od 5.2.3. Ogólny dziennik zapytań
Niestety, to (od 5.6.3) wbudowane zabezpieczenie przed logowaniem haseł dotyczy tylko funkcji MySQL PASSWORD().
Widzę kilka możliwych rozwiązań Twojego problemu:
- Dla każdego zapytania:wyłącz dziennik, wykonaj zapytanie, włącz dziennik
- Zahaszuj hasło w swojej aplikacji (w twoim przypadku php sha)
- Zabezpiecz pliki dziennika, aby nikt nie mógł zobaczyć oświadczeń
- Zaloguj się do aplikacji, która sama usuwa hasła