MyISAM jest szybszy, gdy zapytanie jest proste, ale jest znacznie wolniejszy w środowisku o wysokim współbieżności, niż jego blokada na poziomie tabeli w porównaniu z blokadą na poziomie wiersza w InnoDB.
Tabela MyISAM może po prostu stać się punktem aktywnym i spowalniać każde łączące się zapytanie, więc lepiej jej unikać.