Jak uzyskać unikalny identyfikator z automatycznym przyrostem dla wierszy w wielu tabelach?

możesz użyć UUID.

INSERT INTO mytable(id, name) VALUES(SELECT UUID(), 'some data');

Przeczytaj więcej o UUID:http://mysqlbackupnet. codeplex.com/wikipage?title=Using%20MySQL%20With%20GUID%20lub%20UUID