Odpowiedź znajdziesz tutaj Tworzenie bazy danych podczas uruchamiania docker-compose
Baza danych została prawdopodobnie już zainicjowana. Obraz MySQL nie zmienia konfiguracji bazy danych w kółko, robi to tylko raz. Aby zresetować bazę danych wykonaj docker-compose down -v
gdzie -v
usuwa woluminy zdefiniowane w sekcji głośności.