Rozwiązałem to, ręcznie tworząc sekwencje w ramach mojego skryptu testowego. Nie jest to idealne, ponieważ wolałbym to ustawić w kombinacji Spring/HSQL. Mój kod to:
for (String sequence : sequences) {
entityManager.createNativeQuery("DROP SEQUENCE " + sequence + " IF EXISTS").executeUpdate();
entityManager.createNativeQuery("CREATE SEQUENCE " + sequence + " as INTEGER").executeUpdate();
}
gdzie sekwencje to lista łańcuchów, które są nazwą sekwencji.
Użyłem tej metody @BeforeClass dla każdej klasy testowej. Nie idealne, ale rozwiązuje problem
