Dzieje się tak prawdopodobnie, ponieważ po aktualizacji nie zainstalowałeś ponownie Narzędzi wiersza poleceń.
Zazwyczaj XCode powinien zostać zaktualizowany do najnowszej wersji (4.4) (chyba gdy zaktualizowałem do 10.8, zaktualizowałem też całą masę innych aplikacji, w tym XCode). Po aktualizacji musisz ponownie zainstalować Narzędzia wiersza poleceń. Można to teraz zrobić za pomocą ustawienia w XCode:
Przejdź do „Preferencje -> Pobieranie” i zainstaluj „Narzędzia wiersza poleceń”.
Teraz nie powinieneś mieć więcej problemów podczas instalowania pakietów, które muszą być skompilowane.