Jak zbudować tabelę znormalizowaną z pliku tekstowego zdenormalizowanego?

Używanie gnu awk (ze względu na RS)

awk '{$1=$1} NR%2==1 {printf "%s,",$0} NR%2==0' RS="[,\n]" file
XXXXXXXXXX,YYYYYYYYYY
TTTTTTTTTTT,UUUUUUUUUU
RRRRRRRRR,JJJJJJJJJ
111111111111,22222222222
333333333333,44444444
5555555,666666
EEEEEEEE,WWWWWW
QQQQQQQ,PPPPPPPP

{$1=$1} Czyści i usuwa dodatkowe spacje
NR%2==1 {printf "%s,",$0} drukuje części nieparzyste
NR%2==0 wypisuje nawet część i nową linię
RS="[,\n]" ustawia rekord na , lub nowa linia