Bazy danych programu SQL Server używają dwóch plików — pliku MDF, znanego jako plik podstawowej bazy danych, który zawiera schemat i dane, oraz pliku LDF, który zawiera dzienniki. Zobacz wikipedię. Baza danych może również używać dodatkowego pliku bazy danych, który zwykle używa rozszerzenia .ndf.
Jak wskazuje John S., te rozszerzenia plików są czysto konwencyjne – możesz używać tego, co chcesz, chociaż nie widzę dobrego powodu, aby to robić.
Więcej informacji na temat MSDN można znaleźć tutaj oraz w części Początkowa administracja SQL Server 2005 (Google Books) tutaj.