uprościć instrukcję SQL za pomocą CTE

Użyj CROSS APPLY , którego można użyć do zdefiniowania pól z aliasami, a następnie odwoływania się do nich:

SELECT A.a, 
       A.b, 
       B.c,
       CalculatedValue,
       B.d
FROM    
       dbo.TableA A 
INNER JOIN
        dbo.TableB B 
        ON (...)
CROSS APPLY 
        (SELECT (CASE WHEN ... THEN ... ELSE ... END)) CxA(CalculatedValue)
WHERE CalculatedValue BETWEEN @DayStart AND @DayEnd
GROUP BY A.a, CalculatedValue, B.c

CxA to tylko alias i możesz go nazwać, jak chcesz.