To jest trochę bardziej złożony problem, niż mam ochotę przemyśleć to wszystko teraz, ale dam ci pomysł na początek i może ktoś inny pomoże ci go rozwiązać...
Połącz ze sobą stół w ten sposób:
Select A.JobID, A.Sequence, Count(*)
from TheTable A join
TheTable B on A.JobID <> B.JobID and A.Sequence = B.Sequence
group by A.JobID
Nie testowałem tego, więc mogą być literówki, ale mam nadzieję, że wpadniesz na ten pomysł. Zauważ, że dołączasz tam, gdzie praca nie jest taka sama, ale kolejność jest.