Ponieważ powiedziałeś, że jest to automatyczny proces, który powinien odbywać się codziennie, możesz utworzyć zadanie SSIS (ETL), aby to zrobić i zaplanować zadanie w taki sposób, aby było uruchamiane codziennie.
Oto link który jasno wyjaśni, jak utworzyć pakiet ETL jako źródło pliku płaskiego i miejsce docelowe bazy danych.
Ten link pomoże Ci krok po kroku, jak zaplanować zadanie w SQL Server Agent.
Możesz wybrać ścieżkę folderu zamiast nazwy pliku w źródle, aby zadanie ETL raz dziennie przenosiło wszystkie pliki z folderu do tabeli docelowej.