Jeśli dwie bazy danych znajdują się na tym samym serwerze, powinieneś być w stanie utworzyć instrukcję SQL podobną do tej:
UPDATE Test1.dbo.Employee
SET DeptID = emp2.DeptID
FROM Test2.dbo.Employee as 'emp2'
WHERE
Test1.dbo.Employee.EmployeeID = emp2.EmployeeID
Z Twojego posta nie wiem do końca, czy chcesz aktualizować Test1.dbo.Employee
z wartościami z Test2.dbo.Employee
(to właśnie robi moje zapytanie) lub na odwrót (ponieważ wspomniałeś o bazie danych w Test1
był nowy stół......)