Jak usunąć jeden „dokument” według „identyfikatora” za pomocą oficjalnego sterownika C# dla MongoDB?

Tak to robisz. Jestem pewien, że o tym wiesz, ale jeśli chcesz umieścić to w jednej linii, możesz to połączyć, aby nie trzeba było definiować zmiennej zapytania:

collection.Remove(Query.EQ("_id", a.Id));