Możesz użyć $ operator pozycyjny, aby to zrobić:
db.soup.update(
{_id: ObjectId("50b429ba0e27b508d854483e"), 'array.id': '2'},
{$set: {'array.$.letter': 'c'}})
$ w obiekcie aktualizacji działa jako symbol zastępczy dla pierwszego elementu array pasujące do selektora zapytania.
