Aby uniknąć tego rodzaju problemów, powinieneś instalować oprogramowanie tylko z natywnych repozytoriów Debiana. Niestety nie jest niczym niezwykłym, gdy za takie problemy odpowiadają niechlujne/niekompetentne pakiety innych firm.
Aby odzyskać, spróbuj usunąć plik /var/lib/dpkg/info/mongodb-org-server.postinst
przed próbą apt-get purge mongodb
.