Znalazłem odpowiedź, dość głupią po mojej stronie; wystarczy usunąć dodatkowe nawiasy klamrowe {}
Zamiast tego
db.monitor.update({'_id' : 'dbjkdd'}, { '$push':{'pushed_list': {'$each':{lis1}}}})
Użyj tego
db.monitor.update({'_id' : 'dbjkdd'}, { '$push':{'pushed_list': {'$each':lis1}}})
tj. usuń '{' po '$each' i odpowiadający mu '}'
