Powinieneś załadować pytanie (jak w powyższym kodzie) i użyć linq lub foreach, aby uzyskać element odpowiedzi z określonym _id. Kod będzie wyglądał tak:
List<Question> list = new List<Question>();
MongoServer _server = MongoServer.Create("mongodb://localhost");
MongoDatabase _database = _server.GetDatabase("test");
var query = Query.And(Query.EQ("AnswerChoices._id", new ObjectId("4d6d336ae0f84c23bc1fae00")));
MongoCollection<Question> collection = _database.GetCollection<Question>("Question");
MongoCursor<Question> cursor = collection.Find(query);
var id = new ObjectId("4d6d336ae0f84c23bc1fae00");
foreach (var q in cursor)
{
var answerChoice = q.AnswerChoices.Single(x=> x.AnswerChoiceId == id);
list.Add(q);
}
Proponuję również zamiast Find użyć metody FindOne (ponieważ przypuszczam, że na pewno istnieje tylko jedna odpowiedź z podanym powyżej _id).