Wybierz 3 najnowsze rekordy, w których wartości jednej kolumny są różne

Nie zwraca tego, czego oczekujesz, ponieważ grupowanie odbywa się przed uporządkowaniem, co odzwierciedla pozycja klauzul w instrukcji SQL. Niestety, będziesz musiał stać się bardziej wyrafinowany, aby uzyskać żądane wiersze. Spróbuj tego:

SELECT *
FROM `table`
WHERE `id` = (
    SELECT `id`
    FROM `table` as `alt`
    WHERE `alt`.`otheridentifier` = `table`.`otheridentifier`
    ORDER BY `time` DESC
    LIMIT 1
)
ORDER BY `time` DESC
LIMIT 3