Mój kod zaczął mieć dokładnie ten problem po przeprowadzeniu aktualizacji pakietu w całym systemie 29 marca 2017 r. po raz pierwszy od 2 stycznia 2017 r.
Patrząc na wersje dla RMySQL,RMySQL_0.10.9.tar.gz opublikowane 2016-05-08 15:39RMySQL_0.10.10.tar.gz opublikowane 2017-03-21 07:50
Przywróciłem moją wersję do 0.10.9 i problem zniknął:
require(devtools)
install_version("RMySQL", version = "0.10.9", repos = "http://cran.us.r-project.org")
Zamieściłem Twój problem na stronie z błędami RMySQL, więc zobaczymy, czy go rozwiążą
