Dzięki wskazówce od @AndyHayden ta odpowiedź
była sztuczka. Zasadniczo zastępując mysqlconnector z mysqldb była podporą.
engine = create_engine('mysql+mysqldb://[user]:[pass]@[host]:[port]/[schema]', echo = False)
df.to_sql(name = 'my_table', con = engine, if_exists = 'append', index = False)
Gdzie [schema] to nazwa bazy danych, aw moim konkretnym przypadku :[port] jest pomijany w [host] będąc localhost .