Którego klucza podstawowego użyłeś?
InnoDB używa indeksu klastrowego, więc wszystkie dane są w tej samej kolejności, co indeksy klucza podstawowego.
jeśli nie używasz klucza podstawowego typu auto-inkrementacja, to wykonuje duże operacje dyskowe dla każdego wstawiania. wypycha wszystkie inne dane i wstawia nowy element.
aby uzyskać więcej informacji, spróbuj sprawdzić http:// /dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/innodb-table-and-index.html