MySQL LOAD DATA INFILE i brakujące podwójne cytaty

Musisz wykonać polecenie LOAD DATA INFILE z dodatkową opcją

FIELDS OPTIONALLY ENCLOSED BY '"'

W ten sposób całe oświadczenie staje się

    LOAD DATA INFILE '<FILENAME>' INTO TABLE <TABLENAME>
FIELDS TERMINATED BY ','
OPTIONALLY ENCLOSED BY '"'
LINES TERMINATED BY '\r\n'
(col1, col2, col3, ...)

Więcej informacji można znaleźć w doskonałym Podręczniku MySQL np. dla MySQL 5.1 GA.