Możesz uniknąć tabeli tymczasowej i pętli mysql, którą możesz usunąć z dwóch tabel w jednym zapytaniu i użyć sunquery dla danych tymczasowych
DELETE t1, t2
FROM AppCoverLetter t1
INNER JOIN (
SELECT AppId
FROM ApplyData.AppFormData
where lower(Email) = lower(_email_)
) t3 ON t1.AppID = t3.AppId
INNER JOIN AppError t2 ON t2.AppID = t3.AppId;
lub jeśli masz więcej stolików
DELETE t1, t2, tx
FROM AppCoverLetter t1
INNER JOIN (
SELECT AppId
FROM ApplyData.AppFormData
where lower(Email) = lower(_email_)
) t3 ON t1.AppID = t3.AppId
INNER JOIN AppError t2 ON t2.AppID = t3.AppId
INNER JOIN table3 tx ON tx.AppID = t3.AppId;