Tak naprawdę nie można uzyskać zagnieżdżonych wyników, ale możesz użyćGROUP_CONCAT(DISTINCT store_items.ID ORDER BY ID) AS siIDs
aby uzyskać listę wartości identyfikatorów oddzielonych przecinkami.
Możesz też zmienić separator
http://dev.mysql .com/doc/refman/5.7/en/group-by-functions.html#function_group-concat