Zasadniczo nie ma różnicy między niejawnym sprzężeniem a jawnym JOIN ..ON. Plany wykonania są takie same.
Wolę notację jawną, ponieważ ułatwia ona czytanie i debugowanie. Co więcej, w notacji jawnej definiujesz relację między tabelami w klauzuli ON i warunkiem wyszukiwania w klauzuli WHERE.