MySQL wyodrębnia dane z łańcucha csv i wstawia do drugiej tabeli

INSERT INTO table2 (ID, col1, col2, col3, col4)
  SELECT 
    t1.id
    , substring_index(t1.col1,';',1)
    , substring_index(t1.col1,';',2)
    , substring_index(t1.col1,';',3)
    , substring_index(t1.col1,';',4)
   FROM table1 t1 

Zobacz:http://dev.mysql .com/doc/refman/5.0/en/string-functions.html#function_substring-index