Używanie MyBatis z funkcją Oracle XMLType existingNode()

To jest możliwe. Nie powinieneś kodować ? do pliku MyBatis xml. MyBatis ma specjalny język dla dynamicznego sql, proponuję przeczytać Podręcznik użytkownika MyBatis 3 .

Zmień mapę sql,

<select id="select" parameterType="String" resultMap="urlList">
    select 
                x.t002_id
    from
                 t002_metadata x  
    where
        existsNode(x.t002_xml, #{id}) = 1;
</select>

To może nie być #{id}, to zależy od tego, jak dzwonisz Select z Mybatis. Na przykład możesz używać tagu @Param.