Jak znaleźć relację z bazy danych Snomed Postgres Sql

Według Przeglądarka NHS CT , który może nie być dostępny zewsząd, 93880001 ma troje rodziców:

Złośliwy nowotwór płuc (zaburzenie)
Pierwotny nowotwór złośliwy narządów klatki piersiowej (zaburzenie)
Pierwotny nowotwór złośliwy dróg oddechowych (choroba)

i 31 dzieci:

Rak miąższu płuc (zaburzenie)
Nabłonkowaty hemangioendothelioma płuc (zaburzenie)
Chłoniak nieziarniczy płuc (zaburzenie)
Niedrobnokomórkowy rak płuc (zaburzenie)
i tak dalej...

Sposobem na znalezienie wyższych i niższych poziomów hierarchii jest użycie relationship_f.sourceid i relationship_f.destinationid . Jednak surowe tabele nie są przyjazne dla użytkownika, więc sugerowałbym kilka poglądów. Pobrałem kod z plików Oracle .sql w to Repozytorium GitHub.

Najpierw tworzymy widok z identyfikatorami koncepcji i preferowanymi nazwami:

create view conceptpreferredname as
SELECT distinct c.id conceptId, d.term preferredName, d.id descriptionId
FROM postgres.snomedct.concept_f c
inner JOIN postgres.snomedct.description_f d
  ON c.id = d.conceptId
  AND d.active = '1'
  AND d.typeId = '900000000000013009'
inner JOIN postgres.snomedct.langrefset_f l
  ON d.id = l.referencedComponentId
  AND l.active = '1'
  AND l.refSetId = '900000000000508004'  -- GB English
  AND l.acceptabilityId = '900000000000548007';

Następnie tworzymy widok relacji:

CREATE VIEW relationshipwithnames AS
SELECT id, effectiveTime, active,
    moduleId, cpn1.preferredName moduleIdName,
    sourceId, cpn2.preferredName sourceIdName,
    destinationId, cpn3.preferredName destinationIdName,
    relationshipGroup,
    typeId, cpn4.preferredName typeIdName,
    characteristicTypeId, cpn5.preferredName characteristicTypeIdName,
    modifierId, cpn6.preferredName modifierIdName
from postgres.snomedct.relationship_f relationship,
    conceptpreferredname cpn1,
    conceptpreferredname cpn2,
    conceptpreferredname cpn3,
    conceptpreferredname cpn4,
    conceptpreferredname cpn5,
    conceptpreferredname cpn6
WHERE moduleId = cpn1.conceptId
AND sourceId = cpn2.conceptId
AND destinationId = cpn3.conceptId
AND typeId = cpn4.conceptId
AND characteristicTypeId = cpn5.conceptId
AND modifierId = cpn6.conceptId;

Zatem zapytanie do wydrukowania nazw i identyfikatorów trzech pojęć nadrzędnych będzie wyglądało następująco:

select *
from relationshipwithnames r
where r.sourceId = '93880001'
and r.active = '1'
and r.typeIdName = 'Is a';

Zauważ, że w rzeczywistości zwraca to trzy dodatkowe koncepcje, które przeglądarka internetowa SNOMED uważa za przestarzałe. Nie jestem pewien dlaczego.

Aby wydrukować nazwy i identyfikatory pojęć podrzędnych, zastąp destinationId z sourceId :

select *
from relationshipwithnames r
where r.destinationId = '93880001'
and r.active = '1'
and r.typeIdName = 'Is a';

Zauważ, że w rzeczywistości zwraca to szesnaście dodatkowych pojęć, które przeglądarka internetowa SNOMED uważa za przestarzałe. Ponownie, nie mogę znaleźć niezawodnego sposobu na wykluczenie tylko tych szesnastu z wyników.

Stąd zapytania o dziadków i wnuków są proste.