Spróbuj „w obrębie” zamiast „w pobliżu”. To działa dla mnie,
center = [50, 50];
radius = 1/111.12; //convert it to KM.
db.places.count({"loc" : {"$within" : {"$center" : [center, radius]}}})
Znalazłem to na https://jira.mongodb.org/browse/SERVER-856
